Stage:163

From Master 2 Recherche Biosciences Végétales

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Mécanismes d’adressage aux cellules végétales et fonction d’effecteurs microbiens eucaryotes

Laboratoire d'accueil : LRSV, UMR5546
Equipe d'accueil : Immunité Végétale et Effecteurs Microbiens (B. Dumas)
Encadrant(e)(s) : Elodie GAULIN (gaulin@lrsv.ups-tlse.fr), Barnard DUMAS (dumas@lrsv.ups-tlse.fr) 05 34 32 38 03

Afin de coloniser efficacement leurs hôtes, les microorganismes phytopathogènes eucaryotes filamenteux (champignons, oomycètes…) sécrètent des molécules appelées ‘effecteurs’ modulant la physiologie de la cellule hôte au bénéfice du parasite. Chez les oomycètes, connus souvent sous le terme d’agents du mildiou, deux larges familles d’effecteurs cytosoliques comprenant plusieurs centaines de membres ont été prédites (CRN et RxLR). L’équipe d’accueil s’intéresse plus particulièrement au genre Aphanomyces comprenant des espèces saprophytes, parasites de plantes ou d’animaux. Les données ‘omiques’ générées dans l’équipe ont révélé l’absence de RxLR, l’expansion de CRNs et également de nouvelles familles d’effecteurs candidats pouvant expliquer l’adaptation d’Aphanomyces à l’hôte animal ou végétal. Les premières données fonctionnelles indiquent que certains de ces candidats seraient adressés au noyau de la cellule végétale via un mécanisme inconnu, et favoriseraient la virulence du microorganisme. L’objectif du stage de M2 est de préciser la localisation de ces effecteurs candidats au cours de l’interaction avec la plante hôte notamment par des approches d’immunolocalisation et de décrypter la fonction putative de ces candidats.

Principales Techniques : Microscopie confocale, Immunolocalisation, Clonage, qRT-PCR, Agrotransfection, Manipulation et transformation microorganisme (bactérie, oomycète), Protéines recombinante, Western-blot